More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2958 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 
228 aa  440  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  89.04 
 
 
228 aa  358  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  69.16 
 
 
228 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  66.08 
 
 
228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  70.35 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  68.72 
 
 
227 aa  298  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  66.67 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  35.68 
 
 
230 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  36.12 
 
 
230 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.19 
 
 
233 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.63 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.94 
 
 
243 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.48 
 
 
235 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.33 
 
 
246 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.06 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.75 
 
 
231 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.43 
 
 
246 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.73 
 
 
225 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.67 
 
 
246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.67 
 
 
246 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.43 
 
 
246 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.65 
 
 
234 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  34.01 
 
 
586 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  34.17 
 
 
235 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  33.5 
 
 
586 aa  98.6  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  34.04 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  35.15 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.1 
 
 
210 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.51 
 
 
466 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.31 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  30.57 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.51 
 
 
244 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.5 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  36.76 
 
 
471 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  35.96 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.76 
 
 
471 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.76 
 
 
471 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.98 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  32.18 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.8 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.24 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.5 
 
 
752 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.35 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  35.87 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.77 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.09 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.84 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.1 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.36 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.46 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.89 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.1 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.62 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.04 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.2 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.69 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  31.58 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  32.95 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  33.18 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.37 
 
 
789 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.98 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  30.77 
 
 
630 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.79 
 
 
624 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  29.3 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.82 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  31.09 
 
 
750 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  30.91 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.98 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.04 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.56 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.8 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  33.12 
 
 
605 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.86 
 
 
628 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.91 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.67 
 
 
240 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.67 
 
 
240 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.31 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  30.5 
 
 
575 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  31.82 
 
 
623 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.39 
 
 
608 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.43 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.76 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.31 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.29 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.99 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.68 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.92 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.1 
 
 
624 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2354  cytochrome c biogenesis protein  30.52 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000264437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.18 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  30.22 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.43 
 
 
613 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.43 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.43 
 
 
613 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.92 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.92 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.92 
 
 
602 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>