More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0991 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
421 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  29.03 
 
 
407 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
407 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
407 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
408 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
402 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
413 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
432 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  24.81 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  25.36 
 
 
415 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  27.83 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  25.26 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
410 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
411 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  21.9 
 
 
401 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
417 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  28.54 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
443 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
518 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
420 aa  93.6  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
460 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  22.45 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
357 aa  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  22.09 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.32 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.52 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  20.23 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.78 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.12 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  25.78 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.64 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.3 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.32 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  30.81 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3152  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.64 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.64 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  31.43 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.64 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>