More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0067 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  81.95 
 
 		 211 aa  353  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  78.68 
 
 		 199 aa  337  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  78.06 
 
 		 196 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  78.5 
 
 		 200 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  80 
 
 		 195 aa  313  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  72.68 
 
 		 201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  51.58 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  46.91 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  44.15 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  41.36 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  39.59 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  39 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  39.41 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.69 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  38.74 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.13 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  38.58 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  38.58 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  38.58 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  37.19 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  38.19 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  38.07 
 
 		 272 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  37.95 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  35.1 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  36.71 
 
 		 214 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  39.2 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  37.81 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  39.18 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  34.93 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  35.03 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  35.82 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  38.78 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  36.62 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  36 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  37.06 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  37.06 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  36.32 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  35.53 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  37.31 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  36.18 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  35.35 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  35.1 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  34.2 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  37.02 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  35.64 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  38.66 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  37.11 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  34.09 
 
 		 787 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  37 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  35.32 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  38.66 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  37.63 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  37.2 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  36.36 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  38.78 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.98 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  35.53 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  38.78 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  37.63 
 
 		 380 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  36.04 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  36.46 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  36.36 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  38.07 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  37.11 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  33.63 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  37.76 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  36.18 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  32.18 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  37.11 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  37.11 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  38.14 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>