213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0031 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  100 
 
 
194 aa  403  1e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  98.97 
 
 
194 aa  401  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  86.53 
 
 
216 aa  353  9e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  85.19 
 
 
192 aa  349  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  84.66 
 
 
192 aa  347  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  80.41 
 
 
194 aa  345  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  86.74 
 
 
182 aa  336  1e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  41.04 
 
 
211 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.16 
 
 
189 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  41.42 
 
 
177 aa  152  3e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  39.89 
 
 
193 aa  152  3e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.52 
 
 
190 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  6.1408e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  36.07 
 
 
204 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  38.67 
 
 
202 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  37.77 
 
 
213 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  37.23 
 
 
213 aa  141  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.04 
 
 
502 aa  140  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.72 
 
 
187 aa  139  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  38.2 
 
 
185 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  34.5 
 
 
188 aa  135  3e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.76 
 
 
508 aa  135  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.87 
 
 
497 aa  134  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  39.08 
 
 
186 aa  133  1e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  37.64 
 
 
193 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  38.51 
 
 
186 aa  130  1e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  35.48 
 
 
189 aa  129  2e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  36.75 
 
 
184 aa  130  2e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  35.71 
 
 
502 aa  127  1e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  32.58 
 
 
192 aa  126  2e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  37.25 
 
 
502 aa  124  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  33.89 
 
 
204 aa  114  1e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
174 aa  110  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  40.68 
 
 
133 aa  101  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  39.8 
 
 
148 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.9 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.77 
 
 
195 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.63 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.73 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09238e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  44.21 
 
 
160 aa  89.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  28.16 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.1 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.65 
 
 
202 aa  83.2  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.27 
 
 
200 aa  83.6  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  27.98 
 
 
210 aa  81.6  6e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.99 
 
 
129 aa  79.7  2e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  26.37 
 
 
203 aa  77.4  1e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  32 
 
 
230 aa  74.7  7e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  39.74 
 
 
156 aa  74.3  1e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.25 
 
 
230 aa  70.5  1e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
367 aa  70.9  1e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  30.88 
 
 
238 aa  68.9  4e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  30.15 
 
 
238 aa  68.6  5e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.71 
 
 
385 aa  68.6  6e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  31.87 
 
 
384 aa  66.6  2e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.09 
 
 
382 aa  67  2e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.77 
 
 
408 aa  66.6  2e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  31.82 
 
 
384 aa  66.6  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  41.77 
 
 
412 aa  66.6  2e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.77 
 
 
384 aa  65.9  4e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.87 
 
 
193 aa  65.9  4e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.13 
 
 
196 aa  65.1  6e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  27.1 
 
 
194 aa  65.1  6e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  34.65 
 
 
246 aa  64.3  9e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.29724e-06 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32 
 
 
439 aa  63.9  1e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.79 
 
 
193 aa  63.9  1e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  23.61 
 
 
253 aa  63.2  2e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  32.94 
 
 
236 aa  63.2  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.04 
 
 
191 aa  63.2  3e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  31.68 
 
 
184 aa  62.4  4e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.68 
 
 
184 aa  62.4  4e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  31.68 
 
 
184 aa  62.4  4e-09  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  28.89 
 
 
398 aa  62.4  4e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  29.89 
 
 
194 aa  61.6  7e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.68 
 
 
184 aa  61.6  7e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  26.37 
 
 
407 aa  61.2  8e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.04 
 
 
437 aa  61.2  1e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  36.49 
 
 
423 aa  60.8  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.63 
 
 
533 aa  61.2  1e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  27.78 
 
 
393 aa  59.7  2e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.97 
 
 
416 aa  59.7  3e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  27.78 
 
 
239 aa  59.7  3e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  27.52 
 
 
280 aa  59.3  4e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  26.42 
 
 
280 aa  58.5  6e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  29.29 
 
 
230 aa  58.5  6e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  29.29 
 
 
230 aa  58.5  6e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  36.14 
 
 
375 aa  58.2  8e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  26.67 
 
 
392 aa  57.8  1e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  32.32 
 
 
418 aa  57.8  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  33.78 
 
 
228 aa  57.4  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  33.78 
 
 
228 aa  57.4  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  4.57726e-09 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  26.67 
 
 
391 aa  56.6  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  30 
 
 
432 aa  57  2e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  33.8 
 
 
314 aa  56.6  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.97 
 
 
192 aa  56.6  2e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0013  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  33.33 
 
 
540 aa  56.2  3e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.779838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.57 
 
 
387 aa  55.8  4e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.12 
 
 
402 aa  55.8  4e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  26.58 
 
 
372 aa  55.5  5e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  28.97 
 
 
192 aa  55.5  5e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  28.09 
 
 
393 aa  55.5  5e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>