116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2329 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 		 312 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.52 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.16 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.93 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  25 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  30.67 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  32.53 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  32.53 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  32.53 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  32.53 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  28.83 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.19 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.19 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.63 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.08 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.24 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.33 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  22.77 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 		 307 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  46.38 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.31 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.51 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>