More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2225 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 404 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  84.3 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  77.94 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  64.16 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  60.45 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  61.95 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  66.49 
 
 		 386 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  62.69 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  61.07 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  62.16 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  60.91 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  60.21 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  60.66 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  56.52 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  55.41 
 
 		 388 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  58.69 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  54.62 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  52.38 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.21 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  52.12 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  52.12 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  49.47 
 
 		 373 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  36.79 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.09 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  34.63 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  36.3 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.7 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.2 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.86 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  32.75 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  31.14 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.62 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.25 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.62 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.25 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.42 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.25 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.42 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.67 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.92 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.43 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.43 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 		 412 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 747 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 782 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 741 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.03 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.77 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 586 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 757 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 586 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.05 
 
 		 585 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 586 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.77 
 
 		 585 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 587 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.9 
 
 		 587 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 585 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.33 
 
 		 720 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.12 
 
 		 585 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.77 
 
 		 671 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 656 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 		 710 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 666 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 585 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 		 664 aa  96.3  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 741 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 657 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  29.73 
 
 		 562 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  28.39 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  28.81 
 
 		 575 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0387  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 565 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 654 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 777 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  27.82 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.15 
 
 		 682 aa  90.5  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.81 
 
 		 583 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.61 
 
 		 650 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 595 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  27.69 
 
 		 558 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  29.25 
 
 		 576 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 674 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>