More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2132 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  65.02 
 
 
249 aa  315  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  36.84 
 
 
231 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  35.12 
 
 
229 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  41.21 
 
 
581 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  34.52 
 
 
229 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
996 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
229 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  34.09 
 
 
231 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  32.34 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1340 aa  92.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  27.05 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
457 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
219 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
219 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  35.36 
 
 
217 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
345 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  27.81 
 
 
681 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
1523 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
1314 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
1523 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  28.05 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
785 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  31.33 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
1162 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  34.12 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.34 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1287 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
1312 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  27.6 
 
 
543 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  37.42 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  36.36 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  25.86 
 
 
746 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
1256 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  27.62 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  35.36 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 
222 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  41.9 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  35.56 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  35.91 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  35 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  35.54 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  44.64 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  26.5 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  37 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.74 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  34.87 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.3 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  43.36 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  34.29 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  34.25 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  35.54 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  36.11 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  34.25 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  42.4 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  34.64 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 
710 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  40.16 
 
 
711 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  39.29 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  34.64 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  34.64 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  45.69 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  45.69 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  32.59 
 
 
201 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
211 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
504 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  35.16 
 
 
195 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  39.22 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  34.07 
 
 
194 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>