50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2620 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  100 
 
 		 487 aa  961    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  28.18 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  32.87 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  26.03 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  32.94 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  31.43 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  31.53 
 
 		 460 aa  177  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  26.95 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  31.41 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  33.33 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  26.62 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  29.07 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  29.12 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  28.34 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  29.82 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  25.58 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.29 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  32.62 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.82 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  29.81 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  28.7 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  27.5 
 
 		 463 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  25.06 
 
 		 456 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  29 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  28.41 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.25 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  27.58 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  26.04 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  29.62 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  27.8 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  27.06 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  28.77 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  29.17 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  30.9 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  25.85 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.44 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  26.87 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.52 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  27.68 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  23.08 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  30.72 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  26.29 
 
 		 476 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  31.1 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  27.37 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  28.74 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.57 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  26.52 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  30.14 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.36 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  26.26 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>