More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0730 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 364 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  85.02 
 
 		 314 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  71.48 
 
 		 298 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  67.95 
 
 		 309 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  68.14 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  65.48 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  69.28 
 
 		 305 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  64.16 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  63.82 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  62.54 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  63.97 
 
 		 311 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 		 295 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.42 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.56 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 325 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.96 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 273 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.11 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 314 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.67 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.9 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.15 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.1 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.15 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  25.67 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 480 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  25.33 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.82 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.58 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  25.23 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  29 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  28.66 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.42 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 320 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 320 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 326 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 230 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>