285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0565 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  78.01 
 
 
142 aa  223  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  70.29 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  64.54 
 
 
141 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  65.96 
 
 
142 aa  183  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  63.12 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  65.19 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  59.57 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  62.5 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  61.94 
 
 
141 aa  156  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  55.71 
 
 
142 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  55.56 
 
 
130 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  55.56 
 
 
130 aa  147  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  53.79 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  54.74 
 
 
139 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  52.11 
 
 
143 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  50.71 
 
 
150 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  48.94 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  49.65 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  47.06 
 
 
142 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  55.81 
 
 
131 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  51.47 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  46.15 
 
 
154 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  47.1 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  47.52 
 
 
343 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  47.52 
 
 
343 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  47.52 
 
 
343 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  45.59 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  49.62 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  51.18 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  45.59 
 
 
142 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  44.53 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  44.53 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  46.94 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  45.39 
 
 
343 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  44.53 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  43.26 
 
 
343 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  44.53 
 
 
339 aa  106  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  48.18 
 
 
143 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  45.16 
 
 
163 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  38.03 
 
 
352 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  43.2 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  43.48 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  40.56 
 
 
142 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  39.84 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  42.02 
 
 
337 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  55.22 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  39.29 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  40.34 
 
 
335 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  43.85 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  40.87 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  44.83 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  50.68 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  50.68 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  50.68 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  47.67 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  39.32 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  50.62 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  44.05 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  50 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  51.39 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  33.83 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  38.71 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  38.71 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  38.71 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  40.23 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  30.66 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  32.12 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  30.63 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  39.36 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  31.39 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  44.16 
 
 
297 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  41.18 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  44.74 
 
 
279 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  36.11 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  30.6 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  30.63 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  29.73 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  35.51 
 
 
332 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  30.77 
 
 
326 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  35.51 
 
 
332 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  32.03 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  32.71 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  46.75 
 
 
311 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85125  Fatty acid synthase subunit beta Includes: 3-hydroxypalmitoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase; Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]; [Acyl-carrier-protein] acetyltransferase; [Acyl-carrier-protein] malonyltransferase; S-acyl fatty acid synthase thioesterase  38.1 
 
 
2075 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  32.71 
 
 
322 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  32.74 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  43.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1747  acyl dehydratase  33.03 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1965  maoC family protein  33.03 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000123748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  38.24 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  43.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  43.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  42.65 
 
 
285 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  33.03 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>