More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2222 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 152 aa  313  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  76.87 
 
 		 151 aa  241  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  73.94 
 
 		 165 aa  231  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  61.31 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  59.56 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  60.61 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  56.93 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  54.35 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.04 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 167 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  38.14 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.82 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  34.96 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  36.36 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  29.53 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  33.06 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  40.2 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.77 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  34.96 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  30.77 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  26.56 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.4 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  33.6 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  31.4 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  29.51 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  31.93 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  31.93 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  32.31 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  29.46 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  32.31 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  29.51 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  33.6 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  29.41 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  33.6 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  33.6 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  33.6 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  33.6 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.28 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30.15 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  30.25 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  32.8 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  31.09 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  31.75 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>