More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0153 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
346 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.37 
 
 
341 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.37 
 
 
341 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.04 
 
 
342 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  48.35 
 
 
340 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
347 aa  332  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.35 
 
 
351 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.35 
 
 
351 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.34 
 
 
319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
351 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.74 
 
 
346 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 
325 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.64 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  38.37 
 
 
331 aa  216  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
332 aa  216  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  39.18 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  37.7 
 
 
332 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
332 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
348 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  37.82 
 
 
322 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
347 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.98 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  32.56 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 
346 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  35.69 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
352 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  36.08 
 
 
337 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  34.57 
 
 
334 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  35.4 
 
 
354 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  32.88 
 
 
335 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
355 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  36.61 
 
 
358 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  30.61 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  30.61 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
363 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  30.91 
 
 
357 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.71 
 
 
346 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  31.86 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  29.33 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  31.63 
 
 
336 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  33.33 
 
 
334 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.83 
 
 
346 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  32.03 
 
 
342 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  30.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  28.41 
 
 
346 aa  119  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  31.56 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  31.56 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  31.54 
 
 
335 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  30.95 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
338 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.79 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  29.6 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.27 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  31.06 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
358 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  31.91 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
339 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  30.99 
 
 
336 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  29.58 
 
 
329 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
333 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
355 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  30.74 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  30.66 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
335 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.74 
 
 
340 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
329 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
355 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  31.84 
 
 
328 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.24 
 
 
329 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  30.31 
 
 
335 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
328 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.07 
 
 
333 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  29.9 
 
 
329 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  44.88 
 
 
155 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
358 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.03 
 
 
328 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  31.21 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  26.02 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28.67 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.57 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.57 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  27 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  28.01 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  28.32 
 
 
336 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  27.71 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  27.08 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.96 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>