More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0914 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  99.27 
 
 		 410 aa  808    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  99.27 
 
 		 410 aa  808    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  99.27 
 
 		 410 aa  808    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  90.15 
 
 		 410 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  99.02 
 
 		 410 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  90.15 
 
 		 410 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  89.95 
 
 		 410 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  99.27 
 
 		 410 aa  808    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  90.15 
 
 		 410 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  99.02 
 
 		 410 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  86 
 
 		 411 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  98.78 
 
 		 410 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  90.15 
 
 		 410 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  100 
 
 		 410 aa  813    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  71.39 
 
 		 409 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  70.9 
 
 		 409 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  71.74 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  71.24 
 
 		 386 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  41.49 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  41.49 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  41.49 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  41.76 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  41.22 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  41.22 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  40.53 
 
 		 410 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  39.49 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  39.49 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  39.49 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  39.49 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  39.49 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 413 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 415 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  43.59 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  43.59 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 405 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.82 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  25.71 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.85 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.63 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.2 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.24 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.63 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.63 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.63 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.73 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.46 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.36 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.29 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.8 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.17 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.15 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  28.45 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.77 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  29.3 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.41 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  26.73 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.44 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  26.73 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.44 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.82 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  27.82 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.74 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.32 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.67 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.32 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4516  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.67 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.04 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.03 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  26.73 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.01 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  24.46 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  26.63 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.06 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.71 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>