More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1099 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2527  GTP-binding protein LepA  83.42 
 
 
597 aa  1021  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1181  GTP-binding protein LepA  57.43 
 
 
601 aa  724  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1179  GTP-binding protein LepA  56.69 
 
 
599 aa  715  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.82196e-05  hitchhiker  0.00186525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01714  GTP-binding protein LepA  69.3 
 
 
596 aa  847  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0925  GTP-binding protein LepA  69.3 
 
 
599 aa  842  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2901  GTP-binding protein LepA  70.37 
 
 
597 aa  895  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127365  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2934  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
599 aa  1234  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0103463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1036  GTP-binding protein LepA  54.05 
 
 
599 aa  691  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0839  GTP-binding protein LepA  69.7 
 
 
597 aa  868  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118985  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3125  GTP-binding protein LepA  59.09 
 
 
616 aa  744  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.801301  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1372  GTP-binding protein LepA  68.95 
 
 
602 aa  848  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1012  GTP-binding protein LepA  69.7 
 
 
597 aa  874  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0411  GTP-binding protein LepA  68.28 
 
 
601 aa  884  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.543301  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0601  GTP-binding protein LepA  67 
 
 
602 aa  853  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90648e-07 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1441  GTP-binding protein LepA  69.12 
 
 
602 aa  849  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.394269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0221  GTP-binding protein LepA  59.26 
 
 
601 aa  746  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.894507  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1090  GTP-binding protein LepA  70.03 
 
 
597 aa  876  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881749  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0753  GTP-binding protein LepA  55.99 
 
 
595 aa  699  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1677  GTP-binding protein LepA  55.57 
 
 
605 aa  692  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1620  GTP-binding protein LepA  62.18 
 
 
600 aa  777  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00547684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1118  GTP-binding protein LepA  65.21 
 
 
600 aa  839  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2962  GTP-binding protein LepA  96.99 
 
 
599 aa  1159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.246369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2746  GTP-binding protein LepA  96.99 
 
 
599 aa  1159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00344282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1883  GTP-binding protein LepA  60.34 
 
 
599 aa  765  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00616157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2246  GTP-binding protein LepA  60.2 
 
 
601 aa  766  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03000  GTP-binding protein LepA  81.14 
 
 
598 aa  1004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.873861  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0098  GTP-binding protein LepA  53.69 
 
 
599 aa  696  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2828  GTP-binding protein LepA  96.99 
 
 
599 aa  1159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2850  GTP-binding protein LepA  96.99 
 
 
599 aa  1159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.997316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2787  GTP-binding protein LepA  96.99 
 
 
599 aa  1159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.212637  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2978  GTP-binding protein LepA  70.12 
 
 
602 aa  864  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0755515  normal  0.0112986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1786  GTP-binding protein LepA  55.65 
 
 
605 aa  699  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1569  GTP-binding protein LepA  57.26 
 
 
604 aa  709  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0109281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0355  GTP-binding protein LepA  59.09 
 
 
603 aa  725  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0900  GTP-binding protein LepA  55.65 
 
 
605 aa  689  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0929  GTP-binding protein LepA  54.79 
 
 
595 aa  692  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0259799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1241  GTP-binding protein LepA  80.81 
 
 
596 aa  1016  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.01097e-06  hitchhiker  4.17727e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3092  GTP-binding protein LepA  57.43 
 
 
600 aa  726  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.779268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1071  GTP-binding protein LepA  73.4 
 
 
599 aa  927  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3671  GTP-binding protein LepA  91.79 
 
 
598 aa  1126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48159  normal  0.889285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1146  GTP-binding protein LepA  81.14 
 
 
596 aa  1020  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.62085e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0855  GTP-binding protein LepA  57.89 
 
 
596 aa  726  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0509078  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2855  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
599 aa  1234  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00888157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2724  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
599 aa  1234  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03538  GTP-binding protein LepA  85.76 
 
 
597 aa  1051  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1619  GTP-binding protein LepA  55.85 
 
 
604 aa  705  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0479  GTP-binding protein LepA  72.51 
 
 
614 aa  910  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1162  GTP-binding protein LepA  60.2 
 
 
601 aa  760  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0264661  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0223  GTP-binding protein LepA  57.6 
 
 
612 aa  748  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.939463  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1454  GTP-binding protein LepA  57.38 
 
 
596 aa  726  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0893898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0767  GTP-binding protein LepA  55.87 
 
 
596 aa  714  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1134  GTP-binding protein LepA  92.32 
 
 
599 aa  1132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  4.78112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0758  GTP-binding protein LepA  58.22 
 
 
596 aa  722  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0424593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2197  GTP-binding protein LepA  59.7 
 
 
601 aa  759  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3046  GTP-binding protein LepA  59.5 
 
 
608 aa  770  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.05213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1035  GTP-binding protein LepA  80.81 
 
 
596 aa  990  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000276893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2106  GTP-binding protein LepA  55.52 
 
 
633 aa  690  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0809  GTP-binding protein LepA  55.57 
 
 
599 aa  711  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.400821  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2722  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
599 aa  1234  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0250495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1108  GTP-binding protein LepA  100 
 
 
599 aa  1234  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312405  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1187  GTP-binding protein LepA  92.32 
 
 
599 aa  1132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2061  GTP-binding protein LepA  59.66 
 
 
602 aa  735  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1181  GTP-binding protein LepA  59.6 
 
 
602 aa  751  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.933427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4376  GTP-binding protein LepA  73.74 
 
 
596 aa  933  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2083  GTP-binding protein LepA  58.32 
 
 
603 aa  727  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.31565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4170  GTP-binding protein LepA  58.45 
 
 
607 aa  750  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.94546e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1240  GTP-binding protein LepA  56.93 
 
 
606 aa  719  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3609  GTP-binding protein LepA  92.32 
 
 
599 aa  1132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00763266  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1688  GTP-binding protein LepA  72.34 
 
 
602 aa  909  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2172  GTP-binding protein LepA  69.87 
 
 
597 aa  873  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5264  GTP-binding protein LepA  66 
 
 
602 aa  842  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2315  GTP-binding protein LepA  58.19 
 
 
604 aa  729  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1276  GTP-binding protein LepA  80.54 
 
 
596 aa  1019  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.30436e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3190  GTP-binding protein LepA  56.16 
 
 
600 aa  699  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000178316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1341  GTP-binding protein LepA  58.19 
 
 
602 aa  740  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3444  GTP-binding protein LepA  56.81 
 
 
603 aa  708  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2248  GTP-binding protein LepA  57.62 
 
 
603 aa  726  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3226  GTP-binding protein LepA  57.94 
 
 
602 aa  743  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000294958  normal  0.140799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2000  GTP-binding protein LepA  59.26 
 
 
602 aa  747  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1652  GTP-binding protein LepA  57.09 
 
 
601 aa  702  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.769555  normal  0.0189215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0801  GTP-binding protein LepA  54.97 
 
 
618 aa  688  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.799005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3168  GTP-binding protein LepA  59.87 
 
 
600 aa  747  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.998124  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07730  GTP-binding protein LepA  56.66 
 
 
600 aa  685  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.590832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10290  GTP-binding protein LepA  57.6 
 
 
601 aa  712  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00168291  unclonable  2.52879e-09 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2078  GTP-binding protein LepA  54.44 
 
 
598 aa  689  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3577  GTP-binding protein LepA  57.65 
 
 
603 aa  718  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4033  GTP-binding protein LepA  54.29 
 
 
595 aa  692  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0111915  normal  0.336417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7070  GTP-binding protein LepA  55.59 
 
 
636 aa  693  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1296  GTP-binding protein LepA  55.63 
 
 
595 aa  687  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2070  GTP-binding protein LepA  53.45 
 
 
595 aa  692  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282271  normal  0.186175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5632  GTP-binding protein LepA  56.3 
 
 
595 aa  720  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374671  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2327  GTP-binding protein LepA  60.5 
 
 
599 aa  767  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0602  GTP-binding protein LepA  59.29 
 
 
599 aa  731  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.921482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1009  GTP-binding protein LepA  57.76 
 
 
609 aa  751  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1202  GTP-binding protein LepA  91.49 
 
 
632 aa  1127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0782657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2371  GTP-binding protein LepA  57.48 
 
 
604 aa  693  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2216  GTP-binding protein LepA  55.56 
 
 
630 aa  687  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1563  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 
603 aa  684  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0660  GTP-binding protein LepA  57.96 
 
 
599 aa  704  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00722233  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1950  GTP-binding protein LepA  70.37 
 
 
601 aa  887  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>