285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0718 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.4187e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.62879e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.05703e-08  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
213 aa  443  1e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  99.53 
 
 
213 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.04863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  99.06 
 
 
213 aa  439  1e-122  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  91.55 
 
 
213 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  91.55 
 
 
213 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.35576e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  91.55 
 
 
213 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  91.55 
 
 
213 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  91.55 
 
 
213 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  83.57 
 
 
213 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  72.25 
 
 
244 aa  336  1e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  74.51 
 
 
227 aa  322  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  72.51 
 
 
227 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  9.26852e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  68.72 
 
 
229 aa  315  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  70.39 
 
 
222 aa  313  2e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  68.45 
 
 
232 aa  305  2e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.29456e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  67.96 
 
 
233 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.57866e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  67.96 
 
 
233 aa  303  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  62.73 
 
 
228 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  68.84 
 
 
223 aa  288  5e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  63.33 
 
 
220 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.31315e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 
217 aa  285  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  63.33 
 
 
220 aa  283  1e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  62.86 
 
 
219 aa  282  2e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.17999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 
218 aa  275  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  61 
 
 
235 aa  274  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  62.25 
 
 
212 aa  270  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  63.32 
 
 
219 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.90793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  61.72 
 
 
218 aa  268  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  61.58 
 
 
216 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  68.93 
 
 
217 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.59181e-05  hitchhiker  8.77638e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  61.22 
 
 
216 aa  258  5e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  67.8 
 
 
219 aa  257  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  68.36 
 
 
217 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  60.3 
 
 
219 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  9.23711e-06  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  68.36 
 
 
217 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  68.36 
 
 
217 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  60.89 
 
 
217 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  60.89 
 
 
217 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.34389e-05  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  61.22 
 
 
219 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  60.4 
 
 
217 aa  255  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  60.3 
 
 
219 aa  255  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05489e-05 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  58.13 
 
 
227 aa  253  1e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  60.4 
 
 
216 aa  250  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  67.82 
 
 
220 aa  250  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  65.5 
 
 
227 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  57.56 
 
 
215 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 
215 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  58.85 
 
 
218 aa  244  7e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  58.33 
 
 
216 aa  243  2e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  60.71 
 
 
205 aa  242  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 
218 aa  241  4e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  54.08 
 
 
199 aa  241  4e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 
216 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 
215 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  54.08 
 
 
199 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 
218 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  58.95 
 
 
214 aa  238  6e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 
217 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 
217 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  53.77 
 
 
236 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  64.57 
 
 
203 aa  235  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  56.77 
 
 
224 aa  233  2e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  61.27 
 
 
226 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  60.69 
 
 
226 aa  226  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  60.8 
 
 
205 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  57.87 
 
 
224 aa  222  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  52.22 
 
 
207 aa  221  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  59.2 
 
 
215 aa  220  2e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  52.76 
 
 
218 aa  215  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  57.39 
 
 
217 aa  215  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  53.73 
 
 
242 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1413  lipoate-protein ligase B  53.23 
 
 
242 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000174244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  53.16 
 
 
209 aa  208  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2569  lipoate-protein ligase B  51.49 
 
 
212 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2199  lipoate-protein ligase B  51.49 
 
 
212 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0165634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  53.06 
 
 
233 aa  205  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
215 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  52.26 
 
 
222 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  49.51 
 
 
255 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
246 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
252 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
249 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
249 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
249 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
254 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  49.27 
 
 
257 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 
218 aa  199  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  60.59 
 
 
264 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  52.22 
 
 
248 aa  195  4e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0400  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 
222 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  50.95 
 
 
241 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 
224 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  50.95 
 
 
241 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>