37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3038 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  100 
 
 		 643 aa  1317    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 278 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 281 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 596 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  39.74 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  40.45 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.05 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1124 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  38.82 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  41.98 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  45.31 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  44.58 
 
 		 197 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 222 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  42.17 
 
 		 192 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  32.22 
 
 		 299 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  31.43 
 
 		 1673 aa  53.9  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.56 
 
 		 242 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  31.11 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 301 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  38.27 
 
 		 712 aa  52  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.64 
 
 		 345 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  48.94 
 
 		 393 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  32.18 
 
 		 220 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  31.3 
 
 		 500 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  32.46 
 
 		 220 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 241 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 243 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  30.86 
 
 		 678 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 1032 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 295 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  30.19 
 
 		 213 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>