More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2376 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 187 aa  386  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  74.65 
 
 		 368 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  73.05 
 
 		 155 aa  222  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  73.05 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  66.9 
 
 		 351 aa  218  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  71.94 
 
 		 320 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  70.92 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  58.6 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 394 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  68.09 
 
 		 380 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  71.01 
 
 		 353 aa  210  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  57.3 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  65.94 
 
 		 397 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.83 
 
 		 311 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  68.28 
 
 		 153 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  71.11 
 
 		 321 aa  207  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  67.38 
 
 		 380 aa  207  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 323 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  66.9 
 
 		 381 aa  205  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  69.63 
 
 		 321 aa  204  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  68.89 
 
 		 321 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  68.89 
 
 		 321 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.89 
 
 		 321 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.89 
 
 		 321 aa  203  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.89 
 
 		 321 aa  203  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.89 
 
 		 321 aa  203  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  68.89 
 
 		 321 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  68.89 
 
 		 321 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  66.91 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.14 
 
 		 416 aa  201  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  61.7 
 
 		 148 aa  198  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  66.19 
 
 		 328 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  62.59 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  63.12 
 
 		 167 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  63.12 
 
 		 167 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  60.71 
 
 		 416 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  67.41 
 
 		 321 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  64.54 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  63.31 
 
 		 368 aa  189  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  65.03 
 
 		 152 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  60.14 
 
 		 352 aa  185  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  58.45 
 
 		 364 aa  183  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  62.77 
 
 		 158 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.87 
 
 		 322 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  63.5 
 
 		 150 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  64.39 
 
 		 157 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 385 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  59.56 
 
 		 735 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  61.19 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 153 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 405 aa  174  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 147 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  62.22 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 142 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 153 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  63.64 
 
 		 153 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  57.75 
 
 		 375 aa  171  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  59.57 
 
 		 359 aa  171  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  58.65 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  58.65 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  58.65 
 
 		 141 aa  167  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  64.39 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  54.41 
 
 		 142 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.64 
 
 		 147 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.8 
 
 		 317 aa  163  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  52.17 
 
 		 329 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  57.55 
 
 		 142 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.93 
 
 		 611 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.94 
 
 		 316 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  53.47 
 
 		 144 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  51.03 
 
 		 346 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.89 
 
 		 590 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.9 
 
 		 348 aa  158  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  57.35 
 
 		 148 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  58.21 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  58.21 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 132 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  51.06 
 
 		 337 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  52.45 
 
 		 144 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 148 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  61.11 
 
 		 149 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  53.9 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  57.04 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  51.77 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 150 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  56.91 
 
 		 138 aa  147  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 146 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  54.2 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>