282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3178 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  71.9 
 
 
249 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  66.53 
 
 
248 aa  324  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  60.92 
 
 
271 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  44.63 
 
 
252 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  40.93 
 
 
245 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  41.91 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  40.59 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  42.08 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  49.76 
 
 
243 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  39 
 
 
239 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  41.28 
 
 
248 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  41.43 
 
 
262 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  48.79 
 
 
243 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  38.84 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  39.67 
 
 
238 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  37.69 
 
 
279 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  45.45 
 
 
241 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  46.25 
 
 
242 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  40.33 
 
 
265 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  38.08 
 
 
240 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  39.92 
 
 
242 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  39.84 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  38.68 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  38.49 
 
 
277 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  40.82 
 
 
241 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  45.15 
 
 
243 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  37.79 
 
 
238 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  34.38 
 
 
264 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  36.9 
 
 
373 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.12 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 
303 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  36.04 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  40.08 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  34.83 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  45.15 
 
 
225 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
254 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
245 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  40.58 
 
 
243 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  33.82 
 
 
244 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 
237 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  40.41 
 
 
245 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  37.29 
 
 
429 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 
246 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  38.17 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  36.27 
 
 
238 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  34.07 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  35.75 
 
 
238 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0458  6-phosphogluconolactonase  36.74 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  33.47 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.9 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  34.95 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  36.5 
 
 
261 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  35.27 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  39.07 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  41.01 
 
 
239 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  36.51 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.74 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  35.98 
 
 
245 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0362  6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 
232 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  32.91 
 
 
246 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  35.45 
 
 
230 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.69 
 
 
238 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  36.32 
 
 
248 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.05 
 
 
245 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  35.51 
 
 
246 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  31.76 
 
 
225 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
235 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
235 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  31.89 
 
 
265 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  31.28 
 
 
238 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  34.19 
 
 
294 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  29.29 
 
 
245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
261 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  32.17 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  34.66 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.95 
 
 
245 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  35.65 
 
 
317 aa  99.8  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0394  6-phosphogluconolactonase  34.38 
 
 
232 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  30.45 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  35.35 
 
 
494 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  36.68 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  34.6 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  34.42 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1558  6-phosphogluconolactonase oxidoreductase protein  35.19 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.041097  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  32.74 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  32.85 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  33.17 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>