More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2270 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  203  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  66.99 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  68.93 
 
 		 103 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  64.08 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  62 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  62 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  59 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  62.77 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  55.88 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  56.7 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  53.54 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  55.88 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  55.88 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  50.98 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  51.96 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  50.5 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  51.49 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  51.96 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  50.5 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  51 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  54.65 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  52.94 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  53 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  54.74 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  51.52 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  48.48 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  53.92 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  50 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47.57 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47.57 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  46.53 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  57.29 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  43.3 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  45 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.16 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  42.55 
 
 		 99 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  45.83 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  51.19 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  45.36 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  47.87 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  41.3 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  45.28 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  51.28 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  38.61 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  42.39 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  41 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  44.79 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  46.34 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  39 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  44.55 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.82 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  37.62 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  43.37 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  43.37 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  38.83 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  38.83 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  40.82 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  43.56 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  40.82 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  39.8 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  38.83 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  39.8 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  40.82 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  44.58 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  39.8 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  39.8 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  44.33 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>