More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0402 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  91.59 
 
 		 107 aa  204  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  88.79 
 
 		 107 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  74.53 
 
 		 106 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  73.83 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  73.58 
 
 		 106 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  62.86 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  63.46 
 
 		 109 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  60.4 
 
 		 109 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  61.46 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  61.54 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  57.69 
 
 		 109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  136  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  56.86 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.94 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  59.62 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  58.95 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  56.86 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  53.4 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  55.79 
 
 		 109 aa  133  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  133  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.49 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  56.73 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  57.43 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.38 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.17 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.89 
 
 		 115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  54.29 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  58.59 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  56.57 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  53.61 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  56.44 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  56.7 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.37 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  56.57 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  56.25 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  54.55 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  56.25 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  60.22 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  58.7 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  54.9 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  59.14 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  56.7 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  52.53 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  59.57 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  54.29 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  53.47 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  58.43 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  53.47 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  57.45 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  60.22 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>