More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0076 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  319  1e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  86.54 
 
 
156 aa  289  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  280  4e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  271  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  250  5e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.3208e-06  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  245  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  237  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.4268e-11  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  229  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.42376e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  2e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.92136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  4e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.41191e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  8e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.84124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.54226e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.19716e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  216  9e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.34832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.71364e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.01536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  216  9e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.53509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
157 aa  216  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.12886e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  215  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.00899e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  216  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.10678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
155 aa  214  3e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  213  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.39374e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  213  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.56375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.22737e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  213  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.1851e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  212  2e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  212  2e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  8.92295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  212  2e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  1.47883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  211  4e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.07065e-08  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
155 aa  210  5e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  209  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  4.72522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.1534e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1222  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
157 aa  208  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  1.88964e-06  hitchhiker  0.00370144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  61.64 
 
 
159 aa  209  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  208  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  207  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.88797e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  204  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  204  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  203  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.43156e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  203  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  203  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  202  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52337e-15 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  202  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.78965e-06  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  201  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  201  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  201  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  3.043e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.77948e-07  unclonable  8.38241e-06 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  200  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.27115e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  199  1e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  199  1e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  3.85897e-05 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  199  1e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  5.71074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  55.77 
 
 
156 aa  199  1e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  199  1e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  199  1e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  2e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  198  2e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  3.12429e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  198  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  3.19623e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  198  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  2.87313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
155 aa  197  4e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  197  4e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  9.75416e-11 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  4e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  57.69 
 
 
156 aa  197  4e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.49814e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  197  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  7.14502e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
155 aa  197  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  197  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.22075e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  196  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  197  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  8e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  8e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  8e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  8e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  196  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.91637e-05  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  196  1e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  1e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  196  1e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.36383e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  196  1e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  1e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.47875e-10  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  196  1e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  195  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>