167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0040 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
327 aa  652  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  40.06 
 
 
343 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  38.98 
 
 
359 aa  246  5e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  38.07 
 
 
328 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  33.64 
 
 
322 aa  179  5e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  34.94 
 
 
572 aa  166  7e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  33.33 
 
 
559 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  31.01 
 
 
330 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  31.63 
 
 
323 aa  148  1e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  31.63 
 
 
324 aa  146  4e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  32.57 
 
 
322 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  135  1e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  33.67 
 
 
548 aa  130  2e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  30.98 
 
 
558 aa  129  8e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  30.3 
 
 
556 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.38523e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  32.29 
 
 
534 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  30.9 
 
 
546 aa  121  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  33.45 
 
 
537 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  30 
 
 
547 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  30.31 
 
 
531 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  30.81 
 
 
356 aa  118  1e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.87754e-09 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  30.27 
 
 
539 aa  117  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  33.79 
 
 
533 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  28.72 
 
 
539 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  28.72 
 
 
539 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  31.86 
 
 
544 aa  115  7e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  31.38 
 
 
539 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  31.03 
 
 
531 aa  115  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  31 
 
 
569 aa  115  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  30.41 
 
 
539 aa  114  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  30.41 
 
 
539 aa  114  2e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  30.41 
 
 
539 aa  114  2e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  32.3 
 
 
552 aa  114  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  30.64 
 
 
322 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  31.96 
 
 
552 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  30.1 
 
 
555 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  29.07 
 
 
539 aa  112  7e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  29.07 
 
 
539 aa  112  8e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  32.06 
 
 
546 aa  111  2e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  28.38 
 
 
547 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  28.37 
 
 
547 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  26.15 
 
 
334 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  29.39 
 
 
551 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  28.47 
 
 
546 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  28.14 
 
 
546 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  29.39 
 
 
508 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  28.52 
 
 
545 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  27.84 
 
 
531 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  30.17 
 
 
546 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  30.61 
 
 
551 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5822  hypothetical protein  27.57 
 
 
431 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324893  normal  0.303543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  28.91 
 
 
551 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  28.76 
 
 
551 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  28.76 
 
 
551 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  28.76 
 
 
551 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  28.76 
 
 
553 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  28.76 
 
 
551 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  28.76 
 
 
551 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  28.76 
 
 
551 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  29.11 
 
 
559 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  28.77 
 
 
559 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  28.62 
 
 
538 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  25.17 
 
 
552 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  26.37 
 
 
543 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  27.61 
 
 
561 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  28.92 
 
 
547 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  27.7 
 
 
537 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.64872e-05  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2177e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  4.76211e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.79419e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.23988e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.62354e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  28.37 
 
 
546 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.10454e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 
546 aa  85.5  1e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  27.91 
 
 
337 aa  85.9  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  26.45 
 
 
545 aa  82.4  1e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  29.97 
 
 
556 aa  81.3  2e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  34.27 
 
 
309 aa  79.7  6e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.12 
 
 
305 aa  79  1e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  28.94 
 
 
555 aa  77  4e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  29.23 
 
 
546 aa  76.6  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  29.23 
 
 
546 aa  76.6  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  29.23 
 
 
546 aa  76.6  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  29.23 
 
 
546 aa  76.6  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  27.14 
 
 
546 aa  76.6  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  28.09 
 
 
546 aa  75.9  8e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0231  hypothetical protein  23.24 
 
 
228 aa  75.5  1e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0232  hypothetical protein  22.89 
 
 
228 aa  75.5  1e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  28.24 
 
 
548 aa  75.1  2e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  27.7 
 
 
547 aa  73.9  3e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  29.5 
 
 
550 aa  73.6  4e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  23.24 
 
 
321 aa  72.8  7e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  27.36 
 
 
326 aa  72.4  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  29.9 
 
 
548 aa  70.5  3e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  26.55 
 
 
548 aa  70.9  3e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  27.81 
 
 
558 aa  70.5  4e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  29.39 
 
 
547 aa  70.5  4e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  28.98 
 
 
547 aa  69.7  6e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>