More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2040 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2040  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1664  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  98.93 
 
 
187 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  0.812799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1048  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.52 
 
 
177 aa  140  1e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2177  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.25 
 
 
178 aa  139  2e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00333036  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2442  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.49 
 
 
178 aa  138  4e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4000  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.49 
 
 
178 aa  138  5e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269761  normal  0.0270518 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0468  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  42.25 
 
 
189 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.78548e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2291  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.11 
 
 
178 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  4.27362e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2141  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.18 
 
 
178 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.426314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2145  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.49 
 
 
178 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000992701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1637  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.49 
 
 
178 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2263  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.94 
 
 
177 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2372  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.76 
 
 
179 aa  135  3e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.53 
 
 
156 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.46494e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.57 
 
 
179 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1143  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.57 
 
 
179 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2144  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.57 
 
 
179 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.86819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1494  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50 
 
 
189 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.7 
 
 
184 aa  134  1e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591774  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2037  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.02 
 
 
179 aa  133  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5433  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.02 
 
 
179 aa  133  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0877391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.02 
 
 
179 aa  133  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2176  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
178 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  5.32163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5950  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.02 
 
 
179 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13672  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1874  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.92 
 
 
179 aa  130  8e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1552  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.93 
 
 
176 aa  130  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00106628  normal  0.0365649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1459  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.67 
 
 
174 aa  129  2e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1057  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.48 
 
 
186 aa  129  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0533537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2656  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1490  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3102  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2600  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0660121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2218  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1709  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2734  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  48.2 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.86 
 
 
176 aa  128  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157881  hitchhiker  0.000462534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0883  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.71 
 
 
197 aa  126  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.667568  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0948  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  45.71 
 
 
197 aa  126  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.636464  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2189  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.89 
 
 
167 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0674  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  47.1 
 
 
157 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.50812e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1018  hypothetical protein  46.32 
 
 
193 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128019  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3459  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.21 
 
 
182 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.15 
 
 
167 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00171818  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4613  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.39 
 
 
163 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1422  rrf2 family protein  44.68 
 
 
163 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1236  transcription factor IscR  44.68 
 
 
163 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507944  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.93 
 
 
153 aa  119  2e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  4.54822e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2060  iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  44.12 
 
 
162 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0325541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3064  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.03 
 
 
157 aa  118  4e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  5.52074e-05  unclonable  6.47935e-07 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.17 
 
 
164 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2207  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  44.93 
 
 
160 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3512  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.44 
 
 
165 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112818  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2883  Rrf2 family protein  43.28 
 
 
162 aa  117  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1343  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.44 
 
 
162 aa  116  2e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.34779e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0884  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.26 
 
 
182 aa  116  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360129  hitchhiker  0.00284827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40410  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  45.8 
 
 
164 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0841  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.55 
 
 
163 aa  115  4e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2752  DNA-binding transcriptional regulator IscR  42.96 
 
 
164 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0761985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0871  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.55 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3444  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.22 
 
 
179 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14710  putative Rrf2 family protein  43.7 
 
 
163 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259526  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  45.19 
 
 
166 aa  114  1e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1243  DNA-binding transcriptional regulator IscR  42.22 
 
 
164 aa  113  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3032  DNA-binding transcriptional regulator IscR  42.22 
 
 
164 aa  113  1e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.178839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1298  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  43.7 
 
 
163 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 
172 aa  113  2e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  9.40296e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3628  DNA-binding transcriptional regulator IscR  38.89 
 
 
164 aa  113  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000895499  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0276  hypothetical protein  43.07 
 
 
188 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00556967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0716  HTH-type transcriptional regulator  42.22 
 
 
168 aa  112  4e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1121  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.96 
 
 
165 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1103  DNA-binding transcriptional regulator IscR  42.22 
 
 
164 aa  111  8e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00126529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0436  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
164 aa  110  8e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.233934  hitchhiker  0.000107797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1131  Rrf2 family protein  41.48 
 
 
168 aa  110  8e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1275  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
185 aa  110  8e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.4653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1167  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
164 aa  110  8e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000157606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1323  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  41.43 
 
 
158 aa  110  1e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  9.41019e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2028  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.12 
 
 
154 aa  110  1e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01355  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.13 
 
 
161 aa  110  2e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0210581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2847  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.84 
 
 
178 aa  110  2e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01054  hypothetical protein  41.13 
 
 
168 aa  110  2e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0280  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
135 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1412  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
164 aa  108  4e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612266  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2989  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
154 aa  108  4e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.2519e-18  normal  0.394533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1775  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.48 
 
 
153 aa  107  8e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175223  hitchhiker  0.000151325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3264  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.58 
 
 
164 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1237  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.42 
 
 
161 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00337607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2586  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.92 
 
 
159 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.254661  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0617  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.3 
 
 
142 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.51443e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1887  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.67 
 
 
158 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
153 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675644  hitchhiker  1.82952e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1487  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.74 
 
 
153 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1486  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.13 
 
 
158 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000176425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1146  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0117595  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1137  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02387  hypothetical protein  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2816  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00041357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2682  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0012048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2684  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2906  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00148392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3763  DNA-binding transcriptional regulator IscR  41.48 
 
 
162 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000105589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>