229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0657 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
270 aa  516  1e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  98.52 
 
 
270 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  59.71 
 
 
280 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  63.18 
 
 
278 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  69.7 
 
 
270 aa  284  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  61.37 
 
 
282 aa  273  2e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.95 
 
 
270 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2567  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  59.07 
 
 
264 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.49 
 
 
264 aa  163  2e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.1 
 
 
267 aa  164  2e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.98 
 
 
276 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  42.59 
 
 
256 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.35 
 
 
257 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.38 
 
 
264 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  41.48 
 
 
259 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.23 
 
 
261 aa  153  3e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  41.25 
 
 
261 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  39 
 
 
295 aa  147  1e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.49 
 
 
277 aa  147  2e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  42.26 
 
 
258 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  40.38 
 
 
258 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.64 
 
 
260 aa  139  5e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.98 
 
 
255 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  39.85 
 
 
258 aa  136  3e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.7 
 
 
259 aa  136  3e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
261 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  38.91 
 
 
250 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  41.13 
 
 
256 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  40.3 
 
 
249 aa  132  7e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  40.75 
 
 
256 aa  130  2e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 
257 aa  128  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.44 
 
 
302 aa  126  4e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  37.6 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  37.6 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.25 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  38.28 
 
 
224 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  37.6 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  41.34 
 
 
258 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  38.58 
 
 
261 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  36.43 
 
 
259 aa  119  4e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  41.15 
 
 
224 aa  119  4e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  33.96 
 
 
262 aa  119  5e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.23 
 
 
253 aa  119  5e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  36.43 
 
 
259 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.67 
 
 
254 aa  110  2e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.36 
 
 
258 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  34.98 
 
 
262 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.69 
 
 
252 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  34.98 
 
 
262 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  34.98 
 
 
262 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.13 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  37.65 
 
 
262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  37.65 
 
 
262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  37.65 
 
 
262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  37.65 
 
 
262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  36.74 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3761  cobalamin synthase  39.08 
 
 
259 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.32 
 
 
266 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.44 
 
 
278 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.23 
 
 
258 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  36.02 
 
 
257 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  39.53 
 
 
260 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  34.59 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.3 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.05 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.29 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  38.49 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.81 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1450  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.38 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.24 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  1.47618e-06  unclonable  2.41437e-08 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  36.23 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3857  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 
280 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.8 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.11 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.72 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  32.16 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.72 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  85.1  1e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  85.1  1e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  37.43 
 
 
260 aa  84.7  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  37.94 
 
 
262 aa  84  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.33 
 
 
247 aa  84.3  2e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  37.43 
 
 
260 aa  84.3  2e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  34.85 
 
 
252 aa  84  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.39 
 
 
242 aa  83.2  4e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  35.52 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  38.46 
 
 
247 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.57 
 
 
247 aa  80.9  2e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  38.46 
 
 
247 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  38.46 
 
 
247 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  38.46 
 
 
240 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  38.46 
 
 
247 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>