278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2488 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  41.41 
 
 
249 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  42.79 
 
 
241 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  40.33 
 
 
245 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  43.42 
 
 
248 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
236 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
236 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  34.4 
 
 
239 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  38.22 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  40.09 
 
 
271 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  35.4 
 
 
241 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  40.3 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  32.9 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  37.17 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  38.96 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  40.49 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  35.43 
 
 
264 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  34.06 
 
 
240 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  35.44 
 
 
245 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  33.46 
 
 
279 aa  131  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  38.16 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  33.59 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  35.15 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  35.44 
 
 
262 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
277 aa  125  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  34.65 
 
 
241 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 
238 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  32.02 
 
 
240 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  33.78 
 
 
245 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
241 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  34.89 
 
 
429 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  38.6 
 
 
242 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.19 
 
 
232 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  36.99 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  36.82 
 
 
235 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  39.32 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  30.8 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  32.58 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.03 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.04 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  34.84 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 
241 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  37.56 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  42.65 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  36.17 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  32.3 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  37.07 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  42.18 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  38.81 
 
 
240 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 
245 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  38.83 
 
 
242 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  36.54 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  32.28 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  31.8 
 
 
294 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  33.73 
 
 
248 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  40.11 
 
 
243 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
254 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  30.74 
 
 
246 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  32.38 
 
 
265 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  31.78 
 
 
246 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  35.06 
 
 
241 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  34.35 
 
 
256 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  35.6 
 
 
447 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  30.58 
 
 
260 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2538  6-phosphogluconolactonase  32.78 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.245115 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
274 aa  99  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  29.36 
 
 
230 aa  98.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  35.61 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  34.05 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  31.9 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  30.28 
 
 
214 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  32.34 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  31.86 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2071  hypothetical protein  31.38 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000857117  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  31.34 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  35.48 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.7 
 
 
238 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  30.54 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  33.17 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
238 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  33.33 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  30.54 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  30.54 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4362  6-phosphogluconolactonase  33.63 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  30.57 
 
 
261 aa  92  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01245  6-phosphogluconolactonase  30.73 
 
 
230 aa  92  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.115638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  29.39 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  29.55 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1893  6-phosphogluconolactonase  31.84 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  32.06 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.14 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2334  6-phosphogluconolactonase  31.12 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17640  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 
237 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1121  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  30.17 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  32.24 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>