More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1685 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  63.22 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  56.25 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  54.02 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  47.13 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  54.02 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  39.53 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  43.68 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  37.93 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>