More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2982 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
828 aa  730    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
838 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
799 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
936 aa  668    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  52.2 
 
 
794 aa  847    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
747 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.4 
 
 
827 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  59.52 
 
 
805 aa  921    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  51.26 
 
 
750 aa  743    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
836 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
826 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  47.7 
 
 
799 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  56.89 
 
 
798 aa  862    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  58.9 
 
 
805 aa  890    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  59.15 
 
 
805 aa  894    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  58.9 
 
 
805 aa  890    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  53.73 
 
 
802 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  48.24 
 
 
759 aa  700    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  45.37 
 
 
860 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  58.52 
 
 
803 aa  908    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  59.15 
 
 
806 aa  894    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  59.15 
 
 
805 aa  894    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  44.21 
 
 
905 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  56.89 
 
 
798 aa  862    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.07 
 
 
819 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  50.67 
 
 
954 aa  765    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  47.52 
 
 
790 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
753 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  49.13 
 
 
748 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  45.92 
 
 
823 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  51.88 
 
 
837 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  46.19 
 
 
797 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  45.56 
 
 
844 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  49.63 
 
 
834 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  50.99 
 
 
759 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  44.04 
 
 
866 aa  705    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
833 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
868 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  54.52 
 
 
836 aa  869    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  58.9 
 
 
805 aa  890    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  47.2 
 
 
828 aa  734    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  51.14 
 
 
747 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  49.75 
 
 
801 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  45.89 
 
 
817 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  51.58 
 
 
857 aa  822    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 
841 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  51.76 
 
 
831 aa  713    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  45.02 
 
 
831 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  49.39 
 
 
742 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
821 aa  1660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
743 aa  896    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
799 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
797 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  52.18 
 
 
792 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  48.86 
 
 
885 aa  765    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  47.09 
 
 
800 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  49.57 
 
 
840 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
836 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  50.85 
 
 
942 aa  767    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  47.43 
 
 
841 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
821 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  48.25 
 
 
748 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.48 
 
 
833 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 
817 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
820 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  50.73 
 
 
838 aa  766    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  53.27 
 
 
796 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
836 aa  761    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  49.88 
 
 
833 aa  732    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
814 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  47.24 
 
 
827 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  46.92 
 
 
804 aa  673    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.29 
 
 
852 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  56.86 
 
 
751 aa  727    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  59.15 
 
 
805 aa  895    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  53.73 
 
 
802 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.36 
 
 
855 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 
829 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  49.33 
 
 
889 aa  787    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
889 aa  786    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
758 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
762 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  49.12 
 
 
740 aa  658    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
836 aa  727    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  53.54 
 
 
799 aa  826    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
790 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  48.77 
 
 
805 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  46.59 
 
 
792 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  59.52 
 
 
806 aa  900    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
857 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 
802 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  50.55 
 
 
814 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  49.46 
 
 
778 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  46.23 
 
 
813 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 
786 aa  735    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  59.77 
 
 
806 aa  904    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  46.2 
 
 
839 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  48.06 
 
 
782 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  59.27 
 
 
797 aa  942    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
1071 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>