More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2334 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  42.23 
 
 		 810 aa  720    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  44.27 
 
 		 818 aa  728    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  55.25 
 
 		 830 aa  947    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  55.41 
 
 		 818 aa  958    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 828 aa  1705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  45.2 
 
 		 821 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  39.83 
 
 		 820 aa  638    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  41.63 
 
 		 842 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  40.27 
 
 		 827 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  40.6 
 
 		 841 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  46.06 
 
 		 820 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  46.78 
 
 		 816 aa  807    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39 
 
 		 842 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  38.93 
 
 		 842 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  39.14 
 
 		 840 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  39.86 
 
 		 843 aa  625  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.64 
 
 		 832 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  40.05 
 
 		 832 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 830 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 835 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  36.55 
 
 		 832 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37.06 
 
 		 836 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  37.62 
 
 		 776 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.77 
 
 		 835 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 835 aa  562  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  36.82 
 
 		 836 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 		 828 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 843 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  37.39 
 
 		 833 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.27 
 
 		 834 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.31 
 
 		 828 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.87 
 
 		 827 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 841 aa  545  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  36.69 
 
 		 835 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  37.65 
 
 		 833 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.89 
 
 		 836 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.53 
 
 		 836 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35 
 
 		 837 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.13 
 
 		 842 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.09 
 
 		 828 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  38.01 
 
 		 854 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  34.98 
 
 		 712 aa  459  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.24 
 
 		 784 aa  432  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30 
 
 		 784 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30 
 
 		 784 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.12 
 
 		 784 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.12 
 
 		 784 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.85 
 
 		 784 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.73 
 
 		 784 aa  422  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.85 
 
 		 784 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.21 
 
 		 785 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  40.56 
 
 		 370 aa  305  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  40.28 
 
 		 370 aa  296  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 		 370 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  44.77 
 
 		 347 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  42.21 
 
 		 343 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  40.39 
 
 		 361 aa  281  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  40.39 
 
 		 361 aa  280  7e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 		 361 aa  279  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  38.94 
 
 		 347 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 399 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  36.75 
 
 		 392 aa  273  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  42.98 
 
 		 346 aa  270  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  40.12 
 
 		 348 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  35.96 
 
 		 392 aa  266  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  43.33 
 
 		 389 aa  263  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 392 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  36.7 
 
 		 387 aa  255  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 		 367 aa  254  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  36.24 
 
 		 366 aa  253  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  41.18 
 
 		 392 aa  252  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  36.53 
 
 		 349 aa  251  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  40.55 
 
 		 392 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 		 388 aa  250  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  40.94 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  41.54 
 
 		 329 aa  248  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.75 
 
 		 392 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.75 
 
 		 392 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  41.28 
 
 		 392 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 387 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 388 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 388 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  40.24 
 
 		 392 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.94 
 
 		 392 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  40.24 
 
 		 392 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  37.65 
 
 		 397 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  39.63 
 
 		 388 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  38.78 
 
 		 389 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  34.52 
 
 		 387 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  37.36 
 
 		 389 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 392 aa  237  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.47 
 
 		 392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  36.7 
 
 		 381 aa  230  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  38.41 
 
 		 376 aa  226  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 		 388 aa  211  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  32.27 
 
 		 364 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  34.16 
 
 		 359 aa  195  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.01 
 
 		 357 aa  190  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>