46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0540 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 168 aa  350  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  56.21 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  54.44 
 
 		 169 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  54.6 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  55.83 
 
 		 170 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  57.74 
 
 		 169 aa  183  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  52.8 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.07 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.06 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  45.34 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  42.33 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.58 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  42.24 
 
 		 165 aa  151  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 		 168 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.89 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.27 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.4 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  37.42 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.81 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.94 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  36.88 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.33 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  34.59 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  33.93 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  34.16 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  36.97 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 		 177 aa  97.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  34.16 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.99 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  34.76 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  32.92 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  34.57 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  32.34 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.9 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  31.64 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  27.78 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  33.94 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  33.09 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  22.22 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  24.38 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>