More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3227 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 675 aa  1373    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 		 622 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  37.35 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  40.96 
 
 		 600 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.67 
 
 		 650 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  42.02 
 
 		 592 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  41.27 
 
 		 611 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 600 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.79 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 607 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.76 
 
 		 588 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  39.4 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  39.1 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  40.43 
 
 		 610 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.86 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 608 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  37.29 
 
 		 616 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.15 
 
 		 614 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  32.86 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  35.33 
 
 		 587 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.85 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.68 
 
 		 623 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.73 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.7 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 620 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.43 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  35.4 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  36.22 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.77 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  34.91 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  37.57 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.72 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  36.5 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.73 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.74 
 
 		 589 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 663 aa  365  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.2 
 
 		 597 aa  364  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.75 
 
 		 587 aa  364  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  32.23 
 
 		 645 aa  363  5.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.59 
 
 		 611 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  35.76 
 
 		 579 aa  362  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  35.76 
 
 		 579 aa  362  9e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.57 
 
 		 663 aa  362  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.94 
 
 		 592 aa  361  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.04 
 
 		 587 aa  360  4e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.22 
 
 		 614 aa  360  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.28 
 
 		 597 aa  360  7e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.11 
 
 		 721 aa  359  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.28 
 
 		 597 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.68 
 
 		 588 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 586 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.38 
 
 		 666 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.62 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  37.65 
 
 		 672 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  35.19 
 
 		 619 aa  353  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.52 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.32 
 
 		 591 aa  350  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 642 aa  350  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.54 
 
 		 609 aa  350  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  36.95 
 
 		 672 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  35.94 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  35.05 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.1 
 
 		 581 aa  346  8e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  35.32 
 
 		 606 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.45 
 
 		 640 aa  346  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.91 
 
 		 671 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.33 
 
 		 617 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 600 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.4 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 811 aa  343  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  36.44 
 
 		 620 aa  343  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  37.26 
 
 		 665 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.13 
 
 		 594 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  36.21 
 
 		 606 aa  342  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.63 
 
 		 670 aa  342  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  36.9 
 
 		 631 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.75 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  36.9 
 
 		 631 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  36.25 
 
 		 695 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.95 
 
 		 589 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 733 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  32.19 
 
 		 680 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  37.37 
 
 		 603 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  30.91 
 
 		 585 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.29 
 
 		 621 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 		 613 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  33.78 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 575 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  36.71 
 
 		 631 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  37.88 
 
 		 701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>