More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0855 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  51.9 
 
 
636 aa  685  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
674 aa  1335  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  53.24 
 
 
741 aa  679  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.47 
 
 
697 aa  604  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.45 
 
 
671 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  48.01 
 
 
672 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  45.78 
 
 
665 aa  584  1e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  48.69 
 
 
663 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  46.71 
 
 
688 aa  577  1e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.04486e-09  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  46.67 
 
 
665 aa  573  1e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  45.94 
 
 
666 aa  573  1e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  47.78 
 
 
666 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 
666 aa  562  1e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  45.25 
 
 
658 aa  564  1e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 
672 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  44.95 
 
 
656 aa  539  1e-152  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  44.22 
 
 
664 aa  518  1e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  42.1 
 
 
676 aa  517  1e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  42.99 
 
 
666 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  41.47 
 
 
670 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  39.97 
 
 
682 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  42.34 
 
 
668 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 
664 aa  466  1e-130  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  47.51 
 
 
577 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 
693 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  40.27 
 
 
585 aa  402  1e-110  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  47.46 
 
 
457 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  40.51 
 
 
584 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  40.07 
 
 
586 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 
679 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 
773 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
775 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  39.42 
 
 
584 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 
671 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 
673 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 
762 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 
771 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  37.91 
 
 
582 aa  360  6e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.93 
 
 
648 aa  356  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.88 
 
 
649 aa  354  3e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
649 aa  353  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  33.39 
 
 
650 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
665 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.98 
 
 
648 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
665 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  32.34 
 
 
648 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  32.34 
 
 
648 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 
652 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  31.43 
 
 
648 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.74 
 
 
648 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  31.13 
 
 
648 aa  338  2e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.59 
 
 
648 aa  337  3e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 
662 aa  336  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.24 
 
 
652 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 
654 aa  330  5e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
653 aa  329  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  31.43 
 
 
648 aa  329  1e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 
567 aa  326  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  31.42 
 
 
649 aa  325  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  31.34 
 
 
650 aa  324  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
661 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  32.55 
 
 
661 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
660 aa  322  1e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
666 aa  322  1e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.99 
 
 
567 aa  321  2e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 
567 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  30.61 
 
 
649 aa  316  1e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 
657 aa  314  3e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.74 
 
 
680 aa  314  3e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.33 
 
 
655 aa  314  4e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
674 aa  314  4e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.55 
 
 
720 aa  313  5e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 
668 aa  313  5e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
661 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  33.02 
 
 
660 aa  306  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
659 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  32.87 
 
 
663 aa  306  8e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 
668 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 
668 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 
668 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 
674 aa  305  2e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.18 
 
 
669 aa  305  2e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  27.36 
 
 
662 aa  304  3e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 
656 aa  304  4e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 
666 aa  303  6e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 
678 aa  303  7e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
661 aa  303  8e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 
667 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.18 
 
 
669 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.18 
 
 
669 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.18 
 
 
669 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.18 
 
 
669 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  33.18 
 
 
663 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  33.18 
 
 
669 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  33.02 
 
 
666 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  34.95 
 
 
661 aa  300  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 
667 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
667 aa  297  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  33.75 
 
 
661 aa  296  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  34.39 
 
 
655 aa  296  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>