More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0838 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 431 aa  894    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  51.15 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  49.3 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  51.39 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  48.04 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.85 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.3 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  41.76 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.32 
 
 		 434 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  43.29 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  41.76 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.72 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  43.78 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  43.62 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.72 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  43.02 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  41.76 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  42.92 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  43.65 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  42.13 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  40.6 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  41.67 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  40.74 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  42 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  42.23 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  41.3 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  41.2 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  39.44 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  41.86 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  41.76 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  43.29 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  44.76 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  40.6 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  44.33 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  40.28 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  41.76 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  40.09 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  40.14 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  40.51 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  39.26 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  39.58 
 
 		 433 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  41.63 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.8 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  40.23 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  38.84 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  40.7 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  41.36 
 
 		 430 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  39.72 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  39.44 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  39.46 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  39.44 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  39.54 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  39.43 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  41.04 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  38.57 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  38.57 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  41.13 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  41.61 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  40.29 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  41.13 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  38.57 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  37.67 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  38.57 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  40.59 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  37.81 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  38.83 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  39.34 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  38.37 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  43.84 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  39.9 
 
 		 418 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  39.11 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  39.11 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  39.11 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  41.16 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  39.36 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  39.11 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  38.73 
 
 		 444 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  38.82 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  43.29 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  36.78 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  38.73 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  38.73 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  40.38 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  40.1 
 
 		 436 aa  303  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  43.29 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  35.94 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  39.72 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  36.87 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>