200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_349 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  100 
 
 
165 aa  333  8e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  92.73 
 
 
165 aa  311  2e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  88.48 
 
 
165 aa  296  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  61.21 
 
 
166 aa  207  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  58.02 
 
 
166 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  58.02 
 
 
166 aa  191  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  56.79 
 
 
166 aa  187  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.73 
 
 
166 aa  184  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  54.55 
 
 
166 aa  181  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  56.02 
 
 
165 aa  181  4e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  52.12 
 
 
166 aa  180  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  53.94 
 
 
166 aa  180  8e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  51.52 
 
 
167 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  55.42 
 
 
163 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  51.22 
 
 
166 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  60.61 
 
 
163 aa  176  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  52.17 
 
 
164 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  51.22 
 
 
166 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  52.73 
 
 
173 aa  173  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  55 
 
 
168 aa  172  1e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  56.69 
 
 
168 aa  172  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  50.61 
 
 
166 aa  172  2e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  53.61 
 
 
172 aa  171  3e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  54.37 
 
 
168 aa  171  3e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.91 
 
 
166 aa  171  4e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  50 
 
 
166 aa  171  4e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  53.37 
 
 
164 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  54.37 
 
 
168 aa  167  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  49.39 
 
 
165 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  54.55 
 
 
165 aa  165  3e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  53.37 
 
 
164 aa  164  6e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  54.6 
 
 
164 aa  163  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.88 
 
 
168 aa  161  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  51.88 
 
 
167 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  46.34 
 
 
165 aa  157  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  50.97 
 
 
158 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  48.45 
 
 
166 aa  154  5e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  50 
 
 
164 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  45.12 
 
 
166 aa  151  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  47.56 
 
 
166 aa  150  6e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  46.95 
 
 
166 aa  150  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  43.64 
 
 
166 aa  146  1e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  45.45 
 
 
182 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  43.9 
 
 
166 aa  144  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.29 
 
 
185 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  43.29 
 
 
165 aa  141  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  44.87 
 
 
167 aa  140  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.62 
 
 
167 aa  139  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  44.38 
 
 
185 aa  139  2e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.57 
 
 
184 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  42.11 
 
 
184 aa  137  5e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.82 
 
 
182 aa  133  1e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  42.68 
 
 
169 aa  132  1e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  43.67 
 
 
170 aa  131  4e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  43.67 
 
 
170 aa  131  4e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  43.67 
 
 
168 aa  130  7e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40.34 
 
 
182 aa  129  1e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  41.03 
 
 
169 aa  129  2e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  39.43 
 
 
184 aa  126  1e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  47.85 
 
 
169 aa  125  2e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  38.98 
 
 
184 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  40.74 
 
 
170 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  41.1 
 
 
179 aa  117  1e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  43.98 
 
 
167 aa  116  2e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  43.5 
 
 
182 aa  116  2e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.49 
 
 
392 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  42.07 
 
 
179 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  39.63 
 
 
228 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.88 
 
 
233 aa  115  4e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  40.24 
 
 
221 aa  114  8e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  46.92 
 
 
140 aa  113  1e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  39.26 
 
 
178 aa  113  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  39.26 
 
 
178 aa  113  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  40.85 
 
 
178 aa  113  1e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.88 
 
 
178 aa  112  2e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  48.46 
 
 
139 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  47.73 
 
 
140 aa  110  1e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  44.05 
 
 
183 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  47.69 
 
 
146 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  44.05 
 
 
183 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  35.98 
 
 
178 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  44.05 
 
 
183 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  48.8 
 
 
146 aa  107  7e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  36.69 
 
 
179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  36.69 
 
 
179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  46.15 
 
 
139 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  46.15 
 
 
139 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  39.49 
 
 
177 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  46.15 
 
 
139 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  46.15 
 
 
139 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  6.55626e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.16 
 
 
263 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  41.32 
 
 
216 aa  104  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  42.26 
 
 
215 aa  104  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  38.2 
 
 
202 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  42.26 
 
 
179 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  46.09 
 
 
168 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  38.2 
 
 
202 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.94 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>