More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1509 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  96.83 
 
 		 567 aa  1066    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  95.24 
 
 		 567 aa  1056    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 567 aa  1118    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 652 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 673 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 775 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 671 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  38.66 
 
 		 773 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 		 762 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  42.54 
 
 		 662 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  38.91 
 
 		 771 aa  349  7e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 		 665 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 		 665 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 636 aa  339  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 658 aa  332  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 		 664 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.5 
 
 		 697 aa  329  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 674 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 		 741 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 666 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.85 
 
 		 671 aa  320  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.13 
 
 		 672 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  34.63 
 
 		 665 aa  319  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.53 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 573 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 665 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 		 684 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.06 
 
 		 650 aa  299  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.04 
 
 		 682 aa  294  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 		 666 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.87 
 
 		 663 aa  291  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 666 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.04 
 
 		 670 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 664 aa  284  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 		 674 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 656 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  31.82 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 688 aa  280  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.25 
 
 		 693 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  33.27 
 
 		 555 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 		 567 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  32.04 
 
 		 662 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 666 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 		 659 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 565 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 583 aa  277  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.49 
 
 		 674 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  34.21 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  35.6 
 
 		 576 aa  272  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  32.83 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 		 668 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  32.01 
 
 		 563 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.52 
 
 		 558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.52 
 
 		 558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.52 
 
 		 558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.52 
 
 		 558 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 605 aa  270  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 605 aa  270  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  33.96 
 
 		 558 aa  269  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.52 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.52 
 
 		 558 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.52 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  31.27 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  32.9 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  33.33 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  31.75 
 
 		 649 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  32.7 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  32.14 
 
 		 561 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  31.95 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  33.91 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  32.01 
 
 		 563 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 654 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 586 aa  263  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 562 aa  262  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 585 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  31.85 
 
 		 650 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  31.84 
 
 		 566 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.04 
 
 		 648 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 595 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  33.57 
 
 		 607 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 667 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.16 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  33.21 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  32.2 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  33.04 
 
 		 607 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  34.06 
 
 		 569 aa  257  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 667 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  31.92 
 
 		 666 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 649 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.57 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>