More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3750 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
173 aa  359  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  68.1 
 
 
166 aa  238  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.81 
 
 
202 aa  222  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  65.75 
 
 
170 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.87 
 
 
179 aa  214  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  55.42 
 
 
172 aa  213  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.53 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.39 
 
 
226 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
179 aa  210  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
179 aa  210  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
179 aa  210  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
178 aa  209  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
172 aa  209  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  56.36 
 
 
172 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  55.76 
 
 
172 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  62 
 
 
216 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  60.39 
 
 
158 aa  207  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  60.39 
 
 
158 aa  207  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 
250 aa  207  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  59.09 
 
 
159 aa  206  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.18 
 
 
200 aa  206  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  62.84 
 
 
182 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 
268 aa  206  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  58.97 
 
 
158 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  57.32 
 
 
268 aa  206  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.74 
 
 
158 aa  205  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.39 
 
 
167 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.09 
 
 
158 aa  205  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
159 aa  204  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 
200 aa  204  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
158 aa  204  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
158 aa  204  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  63.7 
 
 
182 aa  204  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  59.09 
 
 
158 aa  203  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  63.7 
 
 
184 aa  203  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  55.35 
 
 
264 aa  203  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 
251 aa  203  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  63.7 
 
 
184 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  63.7 
 
 
184 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
170 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
158 aa  202  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.44 
 
 
159 aa  202  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
177 aa  202  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
185 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
226 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
226 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  63.83 
 
 
184 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 
264 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  60.81 
 
 
228 aa  201  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 
182 aa  201  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.53 
 
 
200 aa  201  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 
158 aa  201  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
159 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
184 aa  201  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.38 
 
 
169 aa  201  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
199 aa  201  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 
180 aa  201  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 
271 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 
170 aa  201  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 
160 aa  201  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 
175 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 
160 aa  201  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  57.5 
 
 
207 aa  200  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  61.27 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.38 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 
179 aa  198  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 
170 aa  198  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>