More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2522 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
262 aa  538  1e-152  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  58.02 
 
 
267 aa  307  1e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  59.46 
 
 
267 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  56.59 
 
 
264 aa  288  5e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  56.2 
 
 
264 aa  285  6e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 
270 aa  282  4e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  55.73 
 
 
264 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  55.98 
 
 
260 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
272 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 
260 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  54.9 
 
 
283 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
270 aa  255  6e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  55.29 
 
 
285 aa  254  1e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
265 aa  253  2e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
260 aa  251  8e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
267 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 
263 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
267 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
266 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  52.51 
 
 
266 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
264 aa  244  1e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
270 aa  243  2e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
268 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
267 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
270 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
266 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
268 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
270 aa  239  3e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
288 aa  239  3e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
257 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
266 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
266 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
266 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
266 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
266 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  50.97 
 
 
266 aa  238  6e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  238  6e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
267 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 
268 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
268 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
264 aa  237  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
263 aa  237  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 
268 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  235  5e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
268 aa  235  5e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
264 aa  233  2e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
268 aa  233  2e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.33 
 
 
490 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
269 aa  232  4e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
285 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
271 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 
269 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
436 aa  229  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 
282 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
269 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
269 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
268 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 
272 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
497 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
269 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
269 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
264 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  53.61 
 
 
269 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
266 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
273 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
266 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
269 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
270 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
270 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
497 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
269 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
266 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
271 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 
268 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
267 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
283 aa  222  5e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
267 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  56.03 
 
 
266 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 
285 aa  221  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  53.75 
 
 
266 aa  221  1e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67736e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  51.18 
 
 
484 aa  220  1e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
275 aa  220  2e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>