39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1899 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  801    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.41 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  24.53 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  25.2 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.48 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  23.82 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.26 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  24.59 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  24.3 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  22.04 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.19 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 573 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  20.25 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  20.25 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  19.94 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  23.56 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4177  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>