More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1471 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.26 
 
 
1251 aa  1317    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1284 aa  2649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.24 
 
 
1243 aa  1385    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  46.93 
 
 
1241 aa  1147    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  61.53 
 
 
1256 aa  1655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.93 
 
 
1631 aa  982    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.26 
 
 
1251 aa  1366    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.75 
 
 
1293 aa  1477    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  55.19 
 
 
1231 aa  1384    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.08 
 
 
1244 aa  1383    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  53.13 
 
 
1254 aa  1320    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.23 
 
 
1236 aa  1299    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.25 
 
 
1244 aa  1346    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  56.36 
 
 
1238 aa  1397    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  54.92 
 
 
1266 aa  1465    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.03 
 
 
1266 aa  1468    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  65.52 
 
 
1256 aa  1774    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.89 
 
 
1252 aa  1302    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  47.17 
 
 
1241 aa  1148    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.17 
 
 
962 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.35 
 
 
945 aa  317  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.37 
 
 
947 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.64 
 
 
985 aa  270  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.71 
 
 
981 aa  261  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.32 
 
 
973 aa  261  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.34 
 
 
953 aa  261  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.46 
 
 
953 aa  258  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.06 
 
 
966 aa  257  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.98 
 
 
996 aa  253  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.73 
 
 
953 aa  252  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.4 
 
 
959 aa  250  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.94 
 
 
1004 aa  250  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.17 
 
 
995 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  26.57 
 
 
996 aa  239  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.84 
 
 
996 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.24 
 
 
982 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.32 
 
 
993 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.63 
 
 
766 aa  236  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 
979 aa  236  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.97 
 
 
989 aa  233  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.64 
 
 
989 aa  228  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.05 
 
 
996 aa  224  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.47 
 
 
989 aa  224  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  26.09 
 
 
1020 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.78 
 
 
996 aa  221  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  24.64 
 
 
996 aa  218  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.95 
 
 
979 aa  215  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.16 
 
 
996 aa  212  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.75 
 
 
800 aa  211  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.86 
 
 
993 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.66 
 
 
993 aa  208  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.16 
 
 
768 aa  205  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.93 
 
 
1341 aa  195  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.99 
 
 
993 aa  193  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25.84 
 
 
1032 aa  192  2.9999999999999997e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.79 
 
 
999 aa  191  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.42 
 
 
1298 aa  187  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.16 
 
 
1295 aa  184  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 
946 aa  182  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0187  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.72 
 
 
1342 aa  181  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0359438  normal  0.315795 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.42 
 
 
1007 aa  180  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.16 
 
 
1345 aa  179  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 
1293 aa  179  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.55 
 
 
1231 aa  178  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209803  normal  0.519263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.7 
 
 
1297 aa  177  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.16 
 
 
1004 aa  177  9e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.96 
 
 
1293 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.2 
 
 
1295 aa  177  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.62 
 
 
769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.68 
 
 
751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.31 
 
 
1217 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.3 
 
 
1311 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.33 
 
 
772 aa  175  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.65 
 
 
1293 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.42 
 
 
1293 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.98 
 
 
1221 aa  175  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.84 
 
 
1293 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.84 
 
 
1293 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.16 
 
 
765 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.59 
 
 
1297 aa  173  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.77 
 
 
1301 aa  173  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0750  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.04 
 
 
1309 aa  172  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.44 
 
 
1299 aa  172  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.48 
 
 
1296 aa  172  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.22 
 
 
1214 aa  172  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.34 
 
 
761 aa  171  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1293 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.86 
 
 
1293 aa  171  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.65 
 
 
1293 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.49 
 
 
1295 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.48 
 
 
1306 aa  169  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.43 
 
 
1295 aa  168  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.34 
 
 
1295 aa  168  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.47 
 
 
1293 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.71 
 
 
758 aa  168  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.35 
 
 
1295 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.38 
 
 
1293 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.35 
 
 
1295 aa  168  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.34 
 
 
1295 aa  167  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.57 
 
 
751 aa  167  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>