More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2518 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  100 
 
 		 141 aa  286  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  63.04 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  57.97 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  51.01 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  50 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  46.32 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  53.21 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  46.04 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54.46 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  50.39 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  54.37 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.9 
 
 		 107 aa  124  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.4 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  53.92 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  55.88 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.92 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  48.51 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.5 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  56 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  44.52 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  41.61 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  43.41 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  53.85 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  54.81 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  47.66 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  51.92 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  47.76 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  40.85 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  50.49 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  40.88 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  39.42 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  50.89 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  41.73 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  51.46 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  51.46 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.12 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  45.52 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  60.44 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  49.04 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.92 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.04 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  53.4 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  51.46 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  40.44 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  40.44 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.44 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  52 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  49.51 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  50.98 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  45.54 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  48.65 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  51.92 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  52.53 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>