More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0100 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
127 aa  249  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  59.84 
 
 
122 aa  141  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  56.78 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  52.99 
 
 
119 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  45.95 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  50.86 
 
 
119 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  44.35 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  46.02 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
125 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
121 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  53.91 
 
 
125 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
125 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
125 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
125 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  44.92 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  41.88 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  41.88 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  38.94 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 
120 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
125 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
124 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  39.82 
 
 
124 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  39.82 
 
 
124 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 
125 aa  104  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
119 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 
122 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
118 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
119 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  47.79 
 
 
123 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
123 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 
135 aa  102  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
173 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 
120 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
139 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
124 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  44.35 
 
 
122 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  45.79 
 
 
114 aa  99  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  47.79 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  39.32 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
115 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 
130 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  36.21 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2614  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  54.76 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  44.55 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  49.38 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  36.21 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5319  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5692  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1839  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  40.15 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  46.67 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1791  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2795  regulatory protein ArsR  30.56 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>