More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0050 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.8 
 
 
277 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  46.32 
 
 
233 aa  196  4e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  44.44 
 
 
228 aa  189  6e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  44.44 
 
 
228 aa  189  6e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  45.29 
 
 
234 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  44.71 
 
 
229 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  41.42 
 
 
276 aa  180  3e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  40.17 
 
 
231 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  44.65 
 
 
226 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  43.53 
 
 
285 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  46.29 
 
 
232 aa  174  2e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.26 
 
 
224 aa  173  3e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  42.38 
 
 
233 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  42.79 
 
 
224 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.67 
 
 
225 aa  168  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  40.6 
 
 
228 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.29 
 
 
239 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.84 
 
 
234 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  43.78 
 
 
242 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.84 
 
 
234 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  43.28 
 
 
232 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  41.85 
 
 
225 aa  161  8e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  43.33 
 
 
691 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  40.79 
 
 
227 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.79 
 
 
227 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.39 
 
 
276 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.79 
 
 
227 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  43.06 
 
 
232 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  43.06 
 
 
232 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  43.06 
 
 
242 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  43.06 
 
 
242 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  42.58 
 
 
232 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  42.58 
 
 
242 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  42.58 
 
 
238 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.72 
 
 
231 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  41.26 
 
 
241 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  41.06 
 
 
220 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  44.93 
 
 
212 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.64 
 
 
225 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.75 
 
 
262 aa  153  3e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.1 
 
 
230 aa  153  3e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  44.89 
 
 
261 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  38.4 
 
 
261 aa  152  6e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  43.14 
 
 
239 aa  147  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  38.7 
 
 
326 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  44.97 
 
 
229 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.64 
 
 
245 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  47.64 
 
 
245 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  41.06 
 
 
232 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  39.39 
 
 
228 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  39.39 
 
 
228 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.64 
 
 
245 aa  145  8e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 
232 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.33 
 
 
227 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.16 
 
 
284 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.36 
 
 
231 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.78 
 
 
284 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.97 
 
 
231 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  36.78 
 
 
284 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.4 
 
 
284 aa  141  1e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  42.86 
 
 
228 aa  141  1e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.58 
 
 
284 aa  141  1e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  39.24 
 
 
234 aa  141  1e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 
228 aa  141  1e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.24 
 
 
234 aa  141  1e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.78 
 
 
232 aa  139  5e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  43.07 
 
 
243 aa  139  8e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.99 
 
 
227 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  40.87 
 
 
238 aa  137  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.7 
 
 
249 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  42.49 
 
 
214 aa  135  7e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.13 
 
 
227 aa  135  7e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.7 
 
 
246 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.15 
 
 
242 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  50.61 
 
 
201 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  43.81 
 
 
227 aa  129  7e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  43 
 
 
233 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  42.45 
 
 
222 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.27 
 
 
251 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  42.04 
 
 
201 aa  121  1e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  38.54 
 
 
228 aa  118  1e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  37.63 
 
 
187 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.79 
 
 
198 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.51 
 
 
240 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.08 
 
 
198 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  31.39 
 
 
297 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.87 
 
 
226 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  36.98 
 
 
199 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.31 
 
 
210 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  30.67 
 
 
241 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  29.83 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0320  putative transcription regulator protein  36.49 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.330928  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  31.94 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.49 
 
 
199 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2559  ThiJ/PfpI  45.67 
 
 
148 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.5 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>