More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2793 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  62.14 
 
 
148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  65.93 
 
 
143 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 
148 aa  187  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.5 
 
 
139 aa  185  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  65.67 
 
 
145 aa  185  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  56.83 
 
 
144 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.81 
 
 
138 aa  157  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 
154 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.38 
 
 
137 aa  140  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  57.48 
 
 
139 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  55.12 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  48.12 
 
 
138 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  53.54 
 
 
139 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.86 
 
 
139 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.89 
 
 
152 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.46 
 
 
141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  52.31 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.66 
 
 
143 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  48.2 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  49.62 
 
 
132 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  50.39 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.26 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
138 aa  123  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 
144 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  48.46 
 
 
145 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  43.38 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  44.88 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  47.01 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.12 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  47.62 
 
 
134 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  46.46 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  46.46 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 
150 aa  115  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  44.09 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  44.03 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.26 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
142 aa  115  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  46.03 
 
 
148 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 
140 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  44.53 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
144 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
137 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  46.03 
 
 
134 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  46.76 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  45.8 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  48.36 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.86 
 
 
154 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 
143 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  44.36 
 
 
134 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
142 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
132 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
144 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
142 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.75 
 
 
299 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
143 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
299 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 
157 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  50.96 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.66 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
255 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
287 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.68 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
254 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  40.15 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.69 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  38.35 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  44.34 
 
 
258 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  49.51 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
257 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
258 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
254 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  39.72 
 
 
170 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>