92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2497 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  723    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  90.91 
 
 		 352 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  88 
 
 		 353 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  87.18 
 
 		 353 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  93.47 
 
 		 352 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  79.49 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  79.49 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  62.03 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  61.25 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  60.49 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  56.45 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  55.72 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  56.76 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  56.3 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  54.3 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  54.08 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  51.81 
 
 		 342 aa  355  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  53 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  51.38 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  53.4 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  46.36 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  47.51 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  46.33 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  44.88 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  46.42 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  44.61 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  42.69 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  44.69 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  43.21 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  43.22 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  43.73 
 
 		 332 aa  281  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  41.59 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  40.8 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  40.8 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  41.28 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  42.9 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  42.01 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  40.98 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  43.51 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  44.12 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  42.17 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  43.5 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  44.87 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  42.58 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  42.9 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  40.78 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  41.53 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  42.16 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  41.31 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  45.85 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  40.36 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  40.07 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  42.4 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  41.37 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  38.82 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  40.52 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  42.37 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  40.8 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  29.76 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  46.36 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  43.28 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  41.59 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  41.82 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  41.82 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  39.68 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  44.55 
 
 		 154 aa  105  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  39.67 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  39.32 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  41.23 
 
 		 192 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  40 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  34.68 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  38.71 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  36.43 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  55.13 
 
 		 105 aa  92.8  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  37.93 
 
 		 126 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  31.5 
 
 		 141 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  31.5 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  30.37 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  26.45 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  29.17 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  29.17 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  27.73 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  36.17 
 
 		 117 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 90 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  25.21 
 
 		 135 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  25 
 
 		 108 aa  49.7  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  34.85 
 
 		 81 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  23.91 
 
 		 121 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>