99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0009 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  90.24 
 
 
250 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  85.71 
 
 
248 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  80.33 
 
 
248 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  84.49 
 
 
248 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  76.92 
 
 
252 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  78.01 
 
 
250 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  78.01 
 
 
250 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  76.92 
 
 
252 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  76.92 
 
 
252 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  76.52 
 
 
252 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  77.59 
 
 
250 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  79.01 
 
 
256 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  76.35 
 
 
254 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  79.01 
 
 
256 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  76.11 
 
 
252 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  63.49 
 
 
292 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  65.11 
 
 
253 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  65.53 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  64.5 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  66.23 
 
 
261 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  63.79 
 
 
258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  66.23 
 
 
261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  66.23 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  65.37 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  64.94 
 
 
248 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  64.83 
 
 
275 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  62.7 
 
 
259 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  63.89 
 
 
260 aa  294  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  65.09 
 
 
248 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  65.09 
 
 
248 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  62.3 
 
 
259 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  65.09 
 
 
248 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  62.98 
 
 
254 aa  290  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  63.79 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  71.58 
 
 
195 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  54.51 
 
 
272 aa  255  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  53.31 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  56.25 
 
 
282 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  54.7 
 
 
269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  53.85 
 
 
287 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  47.11 
 
 
258 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  51.38 
 
 
254 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  52.07 
 
 
245 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  51.93 
 
 
268 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  50.85 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  52.05 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  52.36 
 
 
277 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  50.85 
 
 
258 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  53.73 
 
 
269 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  49.19 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  51.39 
 
 
254 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  51.05 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  50.93 
 
 
281 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  50.93 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  53.57 
 
 
255 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  50.23 
 
 
278 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  52.85 
 
 
264 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  46.97 
 
 
276 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  49.24 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  39.58 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  39.17 
 
 
243 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  39.53 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  43.15 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  42.35 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  42.2 
 
 
250 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  42.64 
 
 
218 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  43.5 
 
 
214 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  42.92 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  43.01 
 
 
204 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  34.35 
 
 
362 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  35.1 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  31.4 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  32.35 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  29.38 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  32.58 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  32.64 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  28.99 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  26.92 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  26.72 
 
 
258 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  32.06 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  26.72 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  25.19 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  26.32 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  25.56 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  25.19 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  25.95 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>