297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2988 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  42.09 
 
 
282 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  42.03 
 
 
283 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  40.38 
 
 
285 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  40.38 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  39.25 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  37.31 
 
 
279 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
282 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  36.51 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  34.47 
 
 
276 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  33.85 
 
 
273 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
283 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.46 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.95 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
397 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.03 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  26.61 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.61 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 
427 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  30.2 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.52 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.34 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.92 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  26.15 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  23.72 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.99 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  31.21 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  28.9 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.35 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.77 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.89 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.67 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  25.31 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.16 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.34 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.17 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  26.47 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  29.48 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  29.48 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.12 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  29.48 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  28.42 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.27 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  35.42 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  29.48 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  28.51 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  28.9 
 
 
348 aa  72  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  27.11 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  28.9 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  28.9 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  27.32 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.18 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  28.9 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.69 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.49 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>