125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1739 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.5 
 
 
205 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.88 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.78 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.5 
 
 
213 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.37 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.61 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.11 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.13 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.15 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.76 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.92 
 
 
208 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.5 
 
 
205 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.25 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.3 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  35.78 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.35 
 
 
212 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.64 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.53 
 
 
204 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.45 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.17 
 
 
206 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.68 
 
 
217 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.54 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.54 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  31 
 
 
205 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 
210 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.46 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.93 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.08 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  27.52 
 
 
1010 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  30.16 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.28 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.5 
 
 
546 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.63 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.62 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.62 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.71 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.16 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.84 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.91 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.81 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.06 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.19 
 
 
418 aa  59.3  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  34.06 
 
 
393 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.01 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  31.78 
 
 
554 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.46 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  33.07 
 
 
395 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.78 
 
 
381 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.29 
 
 
422 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.79 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.79 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.63 
 
 
331 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.01 
 
 
417 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.53 
 
 
401 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  30.3 
 
 
546 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  30.3 
 
 
546 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  30.3 
 
 
546 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  30.3 
 
 
546 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  30.3 
 
 
546 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  29.32 
 
 
546 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 
342 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.99 
 
 
369 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  29.32 
 
 
546 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 
398 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 
333 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  29.32 
 
 
548 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  29.55 
 
 
546 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  29.55 
 
 
545 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  28.64 
 
 
331 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.76 
 
 
406 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  26.71 
 
 
339 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  29.1 
 
 
378 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.79 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  22.37 
 
 
321 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.5 
 
 
403 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  31.87 
 
 
375 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.28 
 
 
399 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.63 
 
 
331 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  26.95 
 
 
406 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.74 
 
 
331 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  29.6 
 
 
360 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  28.57 
 
 
334 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.08 
 
 
370 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  21.43 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.78 
 
 
422 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  28.68 
 
 
344 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.08 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.25 
 
 
335 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.11 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.26 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  27.74 
 
 
402 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>