68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2562 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
399 aa  787    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.04 
 
 
403 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.44 
 
 
406 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.9 
 
 
406 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.14 
 
 
422 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.33 
 
 
418 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.63 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.66 
 
 
200 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.68 
 
 
211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.81 
 
 
201 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.96 
 
 
201 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.24 
 
 
203 aa  97.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 
217 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 
204 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2376  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.5 
 
 
228 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.341439  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.93 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.63 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.04 
 
 
546 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.71 
 
 
205 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  25.38 
 
 
1010 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 
198 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0738  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
200 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.972818  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  24 
 
 
229 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1724  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
202 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  23.2 
 
 
204 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  27 
 
 
210 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0258  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.12 
 
 
202 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0178  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
202 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 
229 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  23.49 
 
 
200 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.58 
 
 
205 aa  59.7  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.49 
 
 
229 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.14 
 
 
207 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.2 
 
 
204 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.95 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.87 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.44 
 
 
213 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.87 
 
 
197 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 
204 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.6 
 
 
205 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 
204 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.38 
 
 
201 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
213 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.79 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
217 aa  49.7  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.86 
 
 
213 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.42 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.28 
 
 
205 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.06 
 
 
206 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.67 
 
 
206 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.8 
 
 
208 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.11 
 
 
205 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.78 
 
 
199 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.81 
 
 
211 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.94 
 
 
202 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.84 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.41 
 
 
198 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.06 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.38 
 
 
209 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.38 
 
 
209 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  23.12 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  24.14 
 
 
401 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.9 
 
 
207 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>