242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1599 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  48.97 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  46.92 
 
 
292 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  45.58 
 
 
294 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  48.44 
 
 
289 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  43 
 
 
293 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  46.92 
 
 
292 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  48.29 
 
 
293 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  44.86 
 
 
292 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  45.55 
 
 
291 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  46.23 
 
 
291 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  43.69 
 
 
293 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  39.38 
 
 
292 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  42.47 
 
 
292 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  46.08 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  43.15 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  45.55 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  46.08 
 
 
292 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  45.55 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  46.23 
 
 
291 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  41.78 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  41.44 
 
 
291 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  41.78 
 
 
291 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  41.78 
 
 
291 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  41.78 
 
 
291 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  41.44 
 
 
291 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  41.44 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  41.44 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  41.44 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  41.1 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  41.78 
 
 
291 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  40.41 
 
 
291 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  38.36 
 
 
292 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  36.39 
 
 
294 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  36.39 
 
 
294 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  36.77 
 
 
291 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  39.38 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  36.64 
 
 
290 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  43.84 
 
 
291 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  33.45 
 
 
293 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  37.8 
 
 
291 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  39.25 
 
 
293 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  41.44 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  34.69 
 
 
293 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  35.59 
 
 
294 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  37.46 
 
 
295 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  33.67 
 
 
295 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  34.01 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  34.8 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  35.35 
 
 
326 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  35.05 
 
 
290 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  37.88 
 
 
287 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  37.88 
 
 
287 aa  158  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  34.68 
 
 
289 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  34.69 
 
 
293 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  32.88 
 
 
295 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  33.78 
 
 
296 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  36.3 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  31.53 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  33.9 
 
 
288 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.64 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  35.96 
 
 
287 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  36.95 
 
 
293 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  37.41 
 
 
287 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  37.41 
 
 
287 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  35.96 
 
 
287 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  34.58 
 
 
293 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  33.89 
 
 
295 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  32.19 
 
 
293 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  33.78 
 
 
292 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  32.06 
 
 
287 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  35.96 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  33.78 
 
 
292 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.99 
 
 
288 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1140  hypothetical protein  36.03 
 
 
293 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  34.25 
 
 
287 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  36.7 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  32.54 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  35.96 
 
 
287 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  31.85 
 
 
288 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  33.9 
 
 
287 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  35.62 
 
 
287 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  34.25 
 
 
287 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  32.09 
 
 
295 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  30.87 
 
 
295 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  34.59 
 
 
287 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  30.72 
 
 
291 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  34.25 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  32.32 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  33.67 
 
 
291 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  31.51 
 
 
288 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  31.76 
 
 
287 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  33.89 
 
 
294 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  31.51 
 
 
288 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  32.89 
 
 
287 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>