242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2043 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 439 aa  910    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.79 
 
 		 239 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.83 
 
 		 238 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 239 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 239 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 239 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 239 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 246 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  58.95 
 
 		 239 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.97 
 
 		 254 aa  285  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 239 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  60 
 
 		 239 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 243 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 243 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 243 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.16 
 
 		 239 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 239 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 238 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 239 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 247 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.67 
 
 		 246 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 244 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 250 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 245 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  54.08 
 
 		 255 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  53.19 
 
 		 255 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 240 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 232 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 232 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.8 
 
 		 232 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  54.81 
 
 		 239 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  52.84 
 
 		 258 aa  256  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  54.59 
 
 		 274 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 263 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 239 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.1 
 
 		 236 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 242 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.45 
 
 		 244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 242 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 340 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 240 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 244 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 267 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.35 
 
 		 243 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.26 
 
 		 246 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  46.26 
 
 		 246 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.35 
 
 		 255 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  46.69 
 
 		 259 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  45.75 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  45.38 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  45.16 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  44.98 
 
 		 269 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 255 aa  209  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 245 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 260 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.38 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 260 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 260 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 260 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  41.33 
 
 		 234 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 231 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  40.43 
 
 		 242 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 232 aa  171  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 		 230 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  37.85 
 
 		 230 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 238 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  36.1 
 
 		 236 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.09 
 
 		 235 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  36.51 
 
 		 236 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 248 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  34.84 
 
 		 252 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.39 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 262 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 247 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 236 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 260 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 260 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>