More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0055 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  92.06 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>